Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sf3b2Q3UJB0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Sf3b2Q3UJB0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Sf3b2Q3UJB0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sf3b2Q3UJB0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sf3b2Q3UJB0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sf3b2Q3UJB0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sf3b2Q3UJB0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Sf3b2Q3UJB0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sf3b2Q3UJB0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sf3b2Q3UJB0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sf3b2Q3UJB0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sf3b2Q3UJB0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sf3b2Q3UJB0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sf3b2Q3UJB0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sf3b2Q3UJB0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sf3b2Q3UJB0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sf3b2Q3UJB0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sf3b2Q3UJB0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Sf3b2Q3UJB0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sf3b2Q3UJB0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sf3b2Q3UJB0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sf3b2Q3UJB0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Sf3b2Q3UJB0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sf3b2Q3UJB0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sf3b2Q3UJB0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sf3b2Q3UJB0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sf3b2Q3UJB0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sf3b2Q3UJB0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sf3b2Q3UJB0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sf3b2Q3UJB0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sf3b2Q3UJB0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sf3b2Q3UJB0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sf3b2Q3UJB0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sf3b2Q3UJB0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sf3b2Q3UJB0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sf3b2Q3UJB0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sf3b2Q3UJB0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sf3b2Q3UJB0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sf3b2Q3UJB0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sf3b2Q3UJB0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Sf3b2Q3UJB0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Sf3b2Q3UJB0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Sf3b2Q3UJB0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sf3b2Q3UJB0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sf3b2Q3UJB0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sf3b2Q3UJB0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Sf3b2Q3UJB0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sf3b2Q3UJB0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Sf3b2Q3UJB0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sf3b2Q3UJB0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sf3b2Q3UJB0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sf3b2Q3UJB0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Sf3b2Q3UJB0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sf3b2Q3UJB0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sf3b2Q3UJB0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sf3b2Q3UJB0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sf3b2Q3UJB0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sf3b2Q3UJB0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sf3b2Q3UJB0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sf3b2Q3UJB0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sf3b2Q3UJB0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sf3b2Q3UJB0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sf3b2Q3UJB0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sf3b2Q3UJB0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sf3b2Q3UJB0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sf3b2Q3UJB0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sf3b2Q3UJB0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sf3b2Q3UJB0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sf3b2Q3UJB0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sf3b2Q3UJB0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sf3b2Q3UJB0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms