Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Arfgef3Q3UGY8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arfgef3Q3UGY8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms