Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Vars2Q3U2A8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms