Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d2bQ3U0J8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms