Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
XylbQ3TNA1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
XylbQ3TNA1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
XylbQ3TNA1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XylbQ3TNA1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XylbQ3TNA1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XylbQ3TNA1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XylbQ3TNA1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XylbQ3TNA1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms