Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Smarca4Q3TKT4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Smarca4Q3TKT4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Smarca4Q3TKT4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Smarca4Q3TKT4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Smarca4Q3TKT4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Smarca4Q3TKT4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Smarca4Q3TKT4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Smarca4Q3TKT4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Smarca4Q3TKT4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Smarca4Q3TKT4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Smarca4Q3TKT4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Smarca4Q3TKT4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Smarca4Q3TKT4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Smarca4Q3TKT4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Smarca4Q3TKT4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Smarca4Q3TKT4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Smarca4Q3TKT4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Smarca4Q3TKT4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
Smarca4Q3TKT4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Smarca4Q3TKT4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Smarca4Q3TKT4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC35.26■■■■□ 3.23
Smarca4Q3TKT4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Smarca4Q3TKT4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Smarca4Q3TKT4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Smarca4Q3TKT4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Smarca4Q3TKT4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Smarca4Q3TKT4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Smarca4Q3TKT4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Smarca4Q3TKT4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Smarca4Q3TKT4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Smarca4Q3TKT4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Smarca4Q3TKT4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Smarca4Q3TKT4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Smarca4Q3TKT4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Smarca4Q3TKT4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Smarca4Q3TKT4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Smarca4Q3TKT4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Smarca4Q3TKT4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Smarca4Q3TKT4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Smarca4Q3TKT4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Smarca4Q3TKT4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Smarca4Q3TKT4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Smarca4Q3TKT4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Smarca4Q3TKT4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Smarca4Q3TKT4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Smarca4Q3TKT4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Smarca4Q3TKT4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Smarca4Q3TKT4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Smarca4Q3TKT4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Smarca4Q3TKT4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Smarca4Q3TKT4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
Smarca4Q3TKT4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Smarca4Q3TKT4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Smarca4Q3TKT4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Smarca4Q3TKT4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Smarca4Q3TKT4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Smarca4Q3TKT4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Smarca4Q3TKT4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Smarca4Q3TKT4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Smarca4Q3TKT4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Smarca4Q3TKT4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Smarca4Q3TKT4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Smarca4Q3TKT4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Smarca4Q3TKT4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Smarca4Q3TKT4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Smarca4Q3TKT4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Smarca4Q3TKT4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Smarca4Q3TKT4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Smarca4Q3TKT4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Smarca4Q3TKT4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Smarca4Q3TKT4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Smarca4Q3TKT4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Smarca4Q3TKT4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Smarca4Q3TKT4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Smarca4Q3TKT4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Smarca4Q3TKT4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Smarca4Q3TKT4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Smarca4Q3TKT4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Smarca4Q3TKT4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Smarca4Q3TKT4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Smarca4Q3TKT4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Smarca4Q3TKT4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Smarca4Q3TKT4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Smarca4Q3TKT4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Smarca4Q3TKT4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Smarca4Q3TKT4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Smarca4Q3TKT4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Smarca4Q3TKT4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Smarca4Q3TKT4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Smarca4Q3TKT4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Smarca4Q3TKT4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Smarca4Q3TKT4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Smarca4Q3TKT4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
Smarca4Q3TKT4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Smarca4Q3TKT4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Smarca4Q3TKT4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Smarca4Q3TKT4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Smarca4Q3TKT4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Smarca4Q3TKT4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms