Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RubcnlQ3TD16 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RubcnlQ3TD16 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RubcnlQ3TD16 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RubcnlQ3TD16 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RubcnlQ3TD16 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RubcnlQ3TD16 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RubcnlQ3TD16 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RubcnlQ3TD16 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RubcnlQ3TD16 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RubcnlQ3TD16 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RubcnlQ3TD16 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RubcnlQ3TD16 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RubcnlQ3TD16 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RubcnlQ3TD16 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RubcnlQ3TD16 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RubcnlQ3TD16 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RubcnlQ3TD16 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RubcnlQ3TD16 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RubcnlQ3TD16 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RubcnlQ3TD16 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RubcnlQ3TD16 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RubcnlQ3TD16 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RubcnlQ3TD16 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RubcnlQ3TD16 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RubcnlQ3TD16 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RubcnlQ3TD16 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RubcnlQ3TD16 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RubcnlQ3TD16 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RubcnlQ3TD16 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RubcnlQ3TD16 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RubcnlQ3TD16 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RubcnlQ3TD16 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RubcnlQ3TD16 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RubcnlQ3TD16 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RubcnlQ3TD16 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RubcnlQ3TD16 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RubcnlQ3TD16 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
RubcnlQ3TD16 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms