Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc69Q3TCJ8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms