Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Riiad1Q3KNY5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Riiad1Q3KNY5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Riiad1Q3KNY5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Riiad1Q3KNY5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Riiad1Q3KNY5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Riiad1Q3KNY5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Riiad1Q3KNY5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Riiad1Q3KNY5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Riiad1Q3KNY5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Riiad1Q3KNY5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Riiad1Q3KNY5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Riiad1Q3KNY5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Riiad1Q3KNY5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms