Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdgfl1Q2VPR5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdgfl1Q2VPR5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdgfl1Q2VPR5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdgfl1Q2VPR5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdgfl1Q2VPR5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdgfl1Q2VPR5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdgfl1Q2VPR5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdgfl1Q2VPR5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdgfl1Q2VPR5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdgfl1Q2VPR5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdgfl1Q2VPR5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdgfl1Q2VPR5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdgfl1Q2VPR5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdgfl1Q2VPR5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdgfl1Q2VPR5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdgfl1Q2VPR5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdgfl1Q2VPR5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdgfl1Q2VPR5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdgfl1Q2VPR5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdgfl1Q2VPR5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdgfl1Q2VPR5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdgfl1Q2VPR5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hdgfl1Q2VPR5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hdgfl1Q2VPR5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms