Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Perm1Q149B8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Perm1Q149B8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Perm1Q149B8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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