Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Ttc39dQ0VF76 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Ttc39dQ0VF76 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc39dQ0VF76 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc39dQ0VF76 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Ttc39dQ0VF76 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc39dQ0VF76 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Ttc39dQ0VF76 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Ttc39dQ0VF76 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttc39dQ0VF76 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttc39dQ0VF76 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttc39dQ0VF76 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
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Ttc39dQ0VF76 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttc39dQ0VF76 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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