Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cpne7Q0VE82 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cpne7Q0VE82 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cpne7Q0VE82 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cpne7Q0VE82 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cpne7Q0VE82 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cpne7Q0VE82 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cpne7Q0VE82 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cpne7Q0VE82 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cpne7Q0VE82 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cpne7Q0VE82 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cpne7Q0VE82 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cpne7Q0VE82 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cpne7Q0VE82 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cpne7Q0VE82 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cpne7Q0VE82 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cpne7Q0VE82 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cpne7Q0VE82 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cpne7Q0VE82 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cpne7Q0VE82 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cpne7Q0VE82 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cpne7Q0VE82 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cpne7Q0VE82 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cpne7Q0VE82 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cpne7Q0VE82 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cpne7Q0VE82 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cpne7Q0VE82 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cpne7Q0VE82 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cpne7Q0VE82 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cpne7Q0VE82 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cpne7Q0VE82 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cpne7Q0VE82 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cpne7Q0VE82 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cpne7Q0VE82 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms