Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
StumQ0VBF8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
StumQ0VBF8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms