Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms