Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cacna1sQ02789 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cacna1sQ02789 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cacna1sQ02789 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cacna1sQ02789 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cacna1sQ02789 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cacna1sQ02789 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cacna1sQ02789 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cacna1sQ02789 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cacna1sQ02789 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cacna1sQ02789 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cacna1sQ02789 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cacna1sQ02789 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Cacna1sQ02789 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cacna1sQ02789 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cacna1sQ02789 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cacna1sQ02789 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacna1sQ02789 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacna1sQ02789 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacna1sQ02789 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacna1sQ02789 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacna1sQ02789 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacna1sQ02789 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacna1sQ02789 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacna1sQ02789 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacna1sQ02789 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacna1sQ02789 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacna1sQ02789 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacna1sQ02789 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacna1sQ02789 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cacna1sQ02789 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cacna1sQ02789 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cacna1sQ02789 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cacna1sQ02789 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cacna1sQ02789 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cacna1sQ02789 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cacna1sQ02789 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cacna1sQ02789 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cacna1sQ02789 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cacna1sQ02789 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Cacna1sQ02789 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cacna1sQ02789 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cacna1sQ02789 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cacna1sQ02789 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cacna1sQ02789 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cacna1sQ02789 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Cacna1sQ02789 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cacna1sQ02789 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cacna1sQ02789 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cacna1sQ02789 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cacna1sQ02789 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cacna1sQ02789 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cacna1sQ02789 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cacna1sQ02789 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cacna1sQ02789 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cacna1sQ02789 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacna1sQ02789 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacna1sQ02789 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacna1sQ02789 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacna1sQ02789 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacna1sQ02789 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cacna1sQ02789 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Cacna1sQ02789 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cacna1sQ02789 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cacna1sQ02789 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cacna1sQ02789 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cacna1sQ02789 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cacna1sQ02789 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cacna1sQ02789 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cacna1sQ02789 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cacna1sQ02789 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cacna1sQ02789 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cacna1sQ02789 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cacna1sQ02789 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cacna1sQ02789 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cacna1sQ02789 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cacna1sQ02789 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cacna1sQ02789 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cacna1sQ02789 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cacna1sQ02789 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cacna1sQ02789 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cacna1sQ02789 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cacna1sQ02789 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cacna1sQ02789 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cacna1sQ02789 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Cacna1sQ02789 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cacna1sQ02789 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cacna1sQ02789 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cacna1sQ02789 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cacna1sQ02789 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cacna1sQ02789 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cacna1sQ02789 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cacna1sQ02789 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Cacna1sQ02789 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cacna1sQ02789 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cacna1sQ02789 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cacna1sQ02789 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cacna1sQ02789 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cacna1sQ02789 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cacna1sQ02789 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms