Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms