Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cry1P97784 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cry1P97784 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cry1P97784 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cry1P97784 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cry1P97784 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cry1P97784 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cry1P97784 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cry1P97784 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cry1P97784 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cry1P97784 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cry1P97784 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cry1P97784 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms