Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otx1P80205 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otx1P80205 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otx1P80205 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otx1P80205 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otx1P80205 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otx1P80205 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Otx1P80205 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otx1P80205 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otx1P80205 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms