Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ufd1P70362 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms