Protein–RNA interactions for Protein: P70314

Pitx1, Pituitary homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx1P70314 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms