Protein–RNA interactions for Protein: P70211

Dcc, Netrin receptor DCC, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DccP70211 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DccP70211 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DccP70211 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DccP70211 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DccP70211 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DccP70211 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DccP70211 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DccP70211 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DccP70211 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DccP70211 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DccP70211 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
DccP70211 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DccP70211 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
DccP70211 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DccP70211 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DccP70211 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DccP70211 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DccP70211 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DccP70211 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DccP70211 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DccP70211 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DccP70211 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DccP70211 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DccP70211 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DccP70211 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DccP70211 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DccP70211 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
DccP70211 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
DccP70211 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DccP70211 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DccP70211 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DccP70211 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DccP70211 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
DccP70211 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DccP70211 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
DccP70211 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DccP70211 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DccP70211 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DccP70211 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
DccP70211 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
DccP70211 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DccP70211 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DccP70211 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
DccP70211 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DccP70211 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DccP70211 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DccP70211 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DccP70211 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DccP70211 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
DccP70211 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DccP70211 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DccP70211 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DccP70211 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DccP70211 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DccP70211 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DccP70211 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DccP70211 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
DccP70211 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DccP70211 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DccP70211 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
DccP70211 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DccP70211 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DccP70211 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DccP70211 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DccP70211 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DccP70211 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DccP70211 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DccP70211 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DccP70211 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DccP70211 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DccP70211 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DccP70211 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DccP70211 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DccP70211 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DccP70211 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DccP70211 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DccP70211 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DccP70211 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DccP70211 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DccP70211 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DccP70211 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DccP70211 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DccP70211 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DccP70211 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DccP70211 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DccP70211 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DccP70211 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DccP70211 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DccP70211 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DccP70211 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DccP70211 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DccP70211 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DccP70211 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DccP70211 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DccP70211 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DccP70211 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DccP70211 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
DccP70211 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DccP70211 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DccP70211 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms