Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms