Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms