Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rin3P59729 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rin3P59729 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rin3P59729 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rin3P59729 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rin3P59729 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rin3P59729 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rin3P59729 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rin3P59729 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rin3P59729 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rin3P59729 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rin3P59729 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms