Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Csrnp3P59055 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Csrnp3P59055 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms