Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms