Protein–RNA interactions for Protein: P56960

Exosc10, Exosome component 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc10P56960 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Exosc10P56960 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Exosc10P56960 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Exosc10P56960 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Exosc10P56960 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Exosc10P56960 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Exosc10P56960 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Exosc10P56960 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Exosc10P56960 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Exosc10P56960 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Exosc10P56960 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Exosc10P56960 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Exosc10P56960 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Exosc10P56960 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Exosc10P56960 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Exosc10P56960 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Exosc10P56960 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Exosc10P56960 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Exosc10P56960 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Exosc10P56960 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Exosc10P56960 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Exosc10P56960 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Exosc10P56960 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Exosc10P56960 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Exosc10P56960 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Exosc10P56960 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Exosc10P56960 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Exosc10P56960 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Exosc10P56960 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Exosc10P56960 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Exosc10P56960 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Exosc10P56960 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Exosc10P56960 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Exosc10P56960 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Exosc10P56960 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Exosc10P56960 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Exosc10P56960 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Exosc10P56960 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Exosc10P56960 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Exosc10P56960 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Exosc10P56960 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Exosc10P56960 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Exosc10P56960 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Exosc10P56960 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Exosc10P56960 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Exosc10P56960 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Exosc10P56960 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Exosc10P56960 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Exosc10P56960 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms