Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd38P56528 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd38P56528 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd38P56528 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd38P56528 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd38P56528 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd38P56528 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd38P56528 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd38P56528 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd38P56528 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd38P56528 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd38P56528 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd38P56528 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd38P56528 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd38P56528 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms