Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GemP55041 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GemP55041 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GemP55041 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GemP55041 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GemP55041 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GemP55041 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GemP55041 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GemP55041 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GemP55041 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GemP55041 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GemP55041 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GemP55041 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GemP55041 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GemP55041 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GemP55041 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GemP55041 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GemP55041 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GemP55041 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GemP55041 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GemP55041 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GemP55041 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GemP55041 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GemP55041 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GemP55041 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GemP55041 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GemP55041 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GemP55041 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GemP55041 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GemP55041 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GemP55041 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GemP55041 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GemP55041 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GemP55041 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GemP55041 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GemP55041 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GemP55041 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GemP55041 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GemP55041 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GemP55041 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GemP55041 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GemP55041 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GemP55041 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GemP55041 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GemP55041 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GemP55041 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GemP55041 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GemP55041 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GemP55041 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GemP55041 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GemP55041 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GemP55041 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GemP55041 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GemP55041 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GemP55041 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GemP55041 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GemP55041 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GemP55041 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GemP55041 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GemP55041 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GemP55041 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GemP55041 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GemP55041 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GemP55041 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GemP55041 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GemP55041 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GemP55041 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GemP55041 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GemP55041 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GemP55041 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GemP55041 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GemP55041 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GemP55041 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GemP55041 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GemP55041 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GemP55041 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GemP55041 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GemP55041 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GemP55041 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GemP55041 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GemP55041 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GemP55041 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GemP55041 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GemP55041 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GemP55041 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GemP55041 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GemP55041 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GemP55041 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GemP55041 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GemP55041 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GemP55041 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GemP55041 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GemP55041 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GemP55041 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GemP55041 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GemP55041 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GemP55041 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GemP55041 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GemP55041 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GemP55041 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms