Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl11P48298 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms