Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rpl13P47963 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms