Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf2P39429 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf2P39429 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf2P39429 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf2P39429 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf2P39429 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf2P39429 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Traf2P39429 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf2P39429 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf2P39429 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf2P39429 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf2P39429 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf2P39429 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf2P39429 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf2P39429 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf2P39429 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf2P39429 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf2P39429 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf2P39429 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf2P39429 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf2P39429 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf2P39429 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf2P39429 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf2P39429 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf2P39429 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf2P39429 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf2P39429 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf2P39429 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf2P39429 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf2P39429 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf2P39429 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf2P39429 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf2P39429 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf2P39429 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf2P39429 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf2P39429 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms