Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PpargP37238 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PpargP37238 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PpargP37238 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PpargP37238 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PpargP37238 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PpargP37238 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PpargP37238 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PpargP37238 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PpargP37238 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PpargP37238 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PpargP37238 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PpargP37238 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PpargP37238 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PpargP37238 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PpargP37238 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PpargP37238 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PpargP37238 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PpargP37238 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PpargP37238 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PpargP37238 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PpargP37238 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PpargP37238 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PpargP37238 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PpargP37238 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PpargP37238 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PpargP37238 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PpargP37238 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PpargP37238 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PpargP37238 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PpargP37238 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PpargP37238 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PpargP37238 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PpargP37238 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PpargP37238 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PpargP37238 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PpargP37238 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PpargP37238 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PpargP37238 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PpargP37238 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PpargP37238 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PpargP37238 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PpargP37238 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PpargP37238 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PpargP37238 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PpargP37238 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PpargP37238 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PpargP37238 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PpargP37238 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PpargP37238 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PpargP37238 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PpargP37238 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PpargP37238 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PpargP37238 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PpargP37238 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PpargP37238 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PpargP37238 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PpargP37238 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PpargP37238 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PpargP37238 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PpargP37238 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PpargP37238 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PpargP37238 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PpargP37238 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PpargP37238 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PpargP37238 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PpargP37238 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PpargP37238 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PpargP37238 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PpargP37238 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PpargP37238 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PpargP37238 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PpargP37238 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PpargP37238 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PpargP37238 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PpargP37238 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PpargP37238 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PpargP37238 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PpargP37238 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PpargP37238 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PpargP37238 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PpargP37238 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PpargP37238 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PpargP37238 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PpargP37238 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PpargP37238 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PpargP37238 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PpargP37238 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PpargP37238 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PpargP37238 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PpargP37238 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PpargP37238 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PpargP37238 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PpargP37238 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PpargP37238 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PpargP37238 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PpargP37238 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PpargP37238 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PpargP37238 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PpargP37238 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms