Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin1P35438 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin1P35438 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin1P35438 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin1P35438 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin1P35438 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin1P35438 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Grin1P35438 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms