Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Pola1P33609 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Pola1P33609 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Pola1P33609 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pola1P33609 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pola1P33609 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pola1P33609 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pola1P33609 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pola1P33609 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pola1P33609 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pola1P33609 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pola1P33609 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pola1P33609 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pola1P33609 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pola1P33609 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pola1P33609 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pola1P33609 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pola1P33609 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pola1P33609 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pola1P33609 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pola1P33609 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pola1P33609 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pola1P33609 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pola1P33609 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pola1P33609 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pola1P33609 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pola1P33609 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pola1P33609 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pola1P33609 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pola1P33609 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pola1P33609 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pola1P33609 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pola1P33609 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pola1P33609 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pola1P33609 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pola1P33609 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pola1P33609 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pola1P33609 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pola1P33609 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pola1P33609 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pola1P33609 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pola1P33609 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pola1P33609 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pola1P33609 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pola1P33609 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Pola1P33609 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pola1P33609 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pola1P33609 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pola1P33609 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Pola1P33609 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pola1P33609 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pola1P33609 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pola1P33609 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Pola1P33609 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pola1P33609 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pola1P33609 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pola1P33609 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pola1P33609 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pola1P33609 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pola1P33609 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pola1P33609 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pola1P33609 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Pola1P33609 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pola1P33609 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pola1P33609 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pola1P33609 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pola1P33609 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pola1P33609 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pola1P33609 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pola1P33609 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pola1P33609 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pola1P33609 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pola1P33609 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pola1P33609 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pola1P33609 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pola1P33609 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pola1P33609 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pola1P33609 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pola1P33609 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Pola1P33609 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pola1P33609 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pola1P33609 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pola1P33609 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Pola1P33609 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pola1P33609 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms