Protein–RNA interactions for Protein: P30681

Hmgb2, High mobility group protein B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb2P30681 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hmgb2P30681 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hmgb2P30681 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hmgb2P30681 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hmgb2P30681 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hmgb2P30681 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Hmgb2P30681 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hmgb2P30681 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hmgb2P30681 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms