Protein–RNA interactions for Protein: P29268

Ctgf, Connective tissue growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtgfP29268 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtgfP29268 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CtgfP29268 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtgfP29268 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtgfP29268 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtgfP29268 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtgfP29268 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtgfP29268 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtgfP29268 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtgfP29268 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtgfP29268 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtgfP29268 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtgfP29268 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtgfP29268 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtgfP29268 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtgfP29268 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtgfP29268 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CtgfP29268 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtgfP29268 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtgfP29268 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtgfP29268 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtgfP29268 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtgfP29268 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtgfP29268 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtgfP29268 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtgfP29268 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtgfP29268 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtgfP29268 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtgfP29268 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtgfP29268 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtgfP29268 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtgfP29268 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtgfP29268 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms