Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apex1P28352 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apex1P28352 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Apex1P28352 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apex1P28352 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apex1P28352 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apex1P28352 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apex1P28352 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apex1P28352 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apex1P28352 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apex1P28352 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apex1P28352 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apex1P28352 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apex1P28352 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apex1P28352 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apex1P28352 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apex1P28352 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms