Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PparaP23204 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PparaP23204 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PparaP23204 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PparaP23204 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PparaP23204 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PparaP23204 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PparaP23204 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PparaP23204 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PparaP23204 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PparaP23204 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PparaP23204 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PparaP23204 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PparaP23204 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PparaP23204 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PparaP23204 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PparaP23204 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PparaP23204 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PparaP23204 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PparaP23204 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PparaP23204 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PparaP23204 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PparaP23204 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PparaP23204 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PparaP23204 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PparaP23204 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PparaP23204 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PparaP23204 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PparaP23204 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PparaP23204 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PparaP23204 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PparaP23204 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PparaP23204 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PparaP23204 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PparaP23204 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PparaP23204 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PparaP23204 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PparaP23204 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PparaP23204 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PparaP23204 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PparaP23204 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PparaP23204 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PparaP23204 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PparaP23204 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PparaP23204 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PparaP23204 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PparaP23204 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PparaP23204 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PparaP23204 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PparaP23204 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PparaP23204 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PparaP23204 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PparaP23204 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PparaP23204 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PparaP23204 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PparaP23204 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PparaP23204 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PparaP23204 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PparaP23204 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PparaP23204 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PparaP23204 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PparaP23204 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PparaP23204 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PparaP23204 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PparaP23204 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PparaP23204 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PparaP23204 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PparaP23204 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PparaP23204 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PparaP23204 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PparaP23204 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PparaP23204 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PparaP23204 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PparaP23204 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PparaP23204 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PparaP23204 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PparaP23204 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PparaP23204 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PparaP23204 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PparaP23204 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PparaP23204 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PparaP23204 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PparaP23204 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PparaP23204 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PparaP23204 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PparaP23204 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PparaP23204 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PparaP23204 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PparaP23204 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PparaP23204 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PparaP23204 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PparaP23204 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PparaP23204 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PparaP23204 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PparaP23204 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PparaP23204 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PparaP23204 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PparaP23204 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PparaP23204 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PparaP23204 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms