Protein–RNA interactions for Protein: P21440

Abcb4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb4P21440 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Abcb4P21440 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcb4P21440 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcb4P21440 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcb4P21440 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcb4P21440 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcb4P21440 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcb4P21440 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcb4P21440 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcb4P21440 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcb4P21440 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcb4P21440 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcb4P21440 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcb4P21440 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcb4P21440 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcb4P21440 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcb4P21440 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcb4P21440 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcb4P21440 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcb4P21440 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcb4P21440 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcb4P21440 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcb4P21440 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcb4P21440 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcb4P21440 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcb4P21440 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcb4P21440 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcb4P21440 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms