Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cox5bP19536 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cox5bP19536 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cox5bP19536 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cox5bP19536 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cox5bP19536 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cox5bP19536 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cox5bP19536 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cox5bP19536 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cox5bP19536 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cox5bP19536 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cox5bP19536 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cox5bP19536 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cox5bP19536 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cox5bP19536 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cox5bP19536 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cox5bP19536 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cox5bP19536 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cox5bP19536 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cox5bP19536 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cox5bP19536 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cox5bP19536 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cox5bP19536 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cox5bP19536 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cox5bP19536 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cox5bP19536 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cox5bP19536 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cox5bP19536 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cox5bP19536 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cox5bP19536 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cox5bP19536 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cox5bP19536 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms