Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NefhP19246 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NefhP19246 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NefhP19246 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NefhP19246 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NefhP19246 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NefhP19246 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NefhP19246 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NefhP19246 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NefhP19246 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NefhP19246 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NefhP19246 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NefhP19246 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NefhP19246 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NefhP19246 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NefhP19246 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NefhP19246 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NefhP19246 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NefhP19246 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NefhP19246 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NefhP19246 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NefhP19246 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NefhP19246 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NefhP19246 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NefhP19246 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NefhP19246 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NefhP19246 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NefhP19246 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NefhP19246 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NefhP19246 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NefhP19246 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NefhP19246 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NefhP19246 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NefhP19246 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NefhP19246 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NefhP19246 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NefhP19246 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NefhP19246 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NefhP19246 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NefhP19246 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NefhP19246 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NefhP19246 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NefhP19246 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NefhP19246 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NefhP19246 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NefhP19246 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NefhP19246 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NefhP19246 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NefhP19246 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NefhP19246 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NefhP19246 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NefhP19246 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NefhP19246 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NefhP19246 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NefhP19246 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NefhP19246 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NefhP19246 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NefhP19246 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NefhP19246 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NefhP19246 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NefhP19246 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NefhP19246 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NefhP19246 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NefhP19246 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NefhP19246 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NefhP19246 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NefhP19246 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NefhP19246 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NefhP19246 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NefhP19246 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NefhP19246 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NefhP19246 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NefhP19246 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NefhP19246 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NefhP19246 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NefhP19246 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NefhP19246 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NefhP19246 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NefhP19246 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NefhP19246 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NefhP19246 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NefhP19246 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NefhP19246 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NefhP19246 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NefhP19246 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NefhP19246 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NefhP19246 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NefhP19246 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NefhP19246 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NefhP19246 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NefhP19246 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NefhP19246 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NefhP19246 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NefhP19246 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NefhP19246 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NefhP19246 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NefhP19246 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NefhP19246 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NefhP19246 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NefhP19246 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms