Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cxcl9P18340 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cxcl9P18340 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cxcl9P18340 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cxcl9P18340 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cxcl9P18340 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cxcl9P18340 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cxcl9P18340 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cxcl9P18340 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cxcl9P18340 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cxcl9P18340 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cxcl9P18340 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cxcl9P18340 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cxcl9P18340 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cxcl9P18340 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cxcl9P18340 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cxcl9P18340 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cxcl9P18340 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cxcl9P18340 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cxcl9P18340 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cxcl9P18340 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cxcl9P18340 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cxcl9P18340 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cxcl9P18340 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cxcl9P18340 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cxcl9P18340 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cxcl9P18340 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cxcl9P18340 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cxcl9P18340 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cxcl9P18340 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cxcl9P18340 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cxcl9P18340 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cxcl9P18340 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cxcl9P18340 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cxcl9P18340 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms