Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PcnaP17918 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PcnaP17918 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PcnaP17918 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PcnaP17918 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PcnaP17918 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PcnaP17918 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PcnaP17918 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PcnaP17918 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PcnaP17918 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PcnaP17918 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PcnaP17918 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms