Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntn1P12960 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntn1P12960 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntn1P12960 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntn1P12960 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntn1P12960 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntn1P12960 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntn1P12960 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntn1P12960 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntn1P12960 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntn1P12960 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntn1P12960 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntn1P12960 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntn1P12960 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntn1P12960 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntn1P12960 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntn1P12960 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntn1P12960 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntn1P12960 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntn1P12960 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntn1P12960 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntn1P12960 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntn1P12960 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntn1P12960 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn1P12960 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn1P12960 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn1P12960 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn1P12960 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn1P12960 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn1P12960 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn1P12960 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn1P12960 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cntn1P12960 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cntn1P12960 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cntn1P12960 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cntn1P12960 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms