Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PolP11369 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PolP11369 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PolP11369 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PolP11369 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PolP11369 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PolP11369 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PolP11369 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PolP11369 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PolP11369 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PolP11369 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PolP11369 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PolP11369 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PolP11369 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PolP11369 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PolP11369 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PolP11369 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PolP11369 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PolP11369 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PolP11369 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PolP11369 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PolP11369 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PolP11369 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PolP11369 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PolP11369 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PolP11369 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PolP11369 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PolP11369 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PolP11369 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PolP11369 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PolP11369 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PolP11369 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PolP11369 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PolP11369 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PolP11369 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PolP11369 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PolP11369 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PolP11369 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PolP11369 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PolP11369 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PolP11369 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PolP11369 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PolP11369 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PolP11369 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PolP11369 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PolP11369 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PolP11369 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PolP11369 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PolP11369 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PolP11369 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PolP11369 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PolP11369 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PolP11369 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PolP11369 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PolP11369 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PolP11369 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PolP11369 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PolP11369 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PolP11369 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PolP11369 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PolP11369 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PolP11369 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PolP11369 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PolP11369 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PolP11369 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PolP11369 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PolP11369 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PolP11369 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PolP11369 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PolP11369 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PolP11369 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PolP11369 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PolP11369 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PolP11369 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PolP11369 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PolP11369 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PolP11369 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PolP11369 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PolP11369 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PolP11369 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PolP11369 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PolP11369 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PolP11369 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PolP11369 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PolP11369 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PolP11369 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PolP11369 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PolP11369 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PolP11369 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PolP11369 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PolP11369 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PolP11369 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PolP11369 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PolP11369 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PolP11369 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PolP11369 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PolP11369 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PolP11369 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PolP11369 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PolP11369 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms