Protein–RNA interactions for Protein: P10300

Cd8b, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd8bP10300 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd8bP10300 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms