Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Surf1P09925 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Surf1P09925 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Surf1P09925 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Surf1P09925 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Surf1P09925 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Surf1P09925 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Surf1P09925 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Surf1P09925 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Surf1P09925 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Surf1P09925 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Surf1P09925 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms