Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col3a1P08121 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms